在位13年，没有任何功绩可言， 是历史上典型的傀儡皇帝。
病死，终年19岁，死后葬于惠陵（今河北遵化西北70里处昌瑞山）。
谥号继天开运受中居正保大定功圣智诚孝信敏恭宽毅皇帝，庙号 穆宗，史称同治皇帝。
载淳死于天花还是梅毒？ 对于载淳的死因，众说纷纭，有的说载淳是死于天花，有的说是死于梅毒。
据记 载，载淳于同治十三年十月三十日得病卧床。
当天下午，太医院判李德立和御医庄守和诊断，结果是: 脉息浮数而细。
系风瘟闭来，阴气不足，不能外透之症，以 致发热头眩，胸满烦闷，身酸腿软，皮肤发出疹形未透，有时气堵作厥。
御医只请第一次脉就能做出上述明确诊断，主要是因为载淳之病来势很凶， 疹形 表发 得较显著。
御医对此开出了用生地、元参、牛蒡子、芦根等十二味药配制的 益阴清解饮 ，进行避风调理。
载淳仅服了一次药，效果便显出来了。
第二天早上，夹 杂着瘟痘的疹形即透出，也不似昨日那样烦闷堵厥了。
但是，疹痘初发，未至出透，致使 瘟热熏蒸肺胃，以致咽喉干痛，胸满作呕，头眩身热，气颤谵言 。
御医 议用 清解利咽汤 对此进行调理。
巳初三刻服药后，效果明显，是日午刻即 脉息浮洪，头面周身疹中夹杂之痘颗粒透出 。
这样，经御医 们精心医治护理不足两天，痘颗虽然开始表发了，有些症状也有减退的迹象，但是由于瘟热毒滞过盛，以致头面、颈项发出的痘粒很稠密，而且痘颗颜色紫滞，又有 咽痛作呕，身颤口干，便秘溺赤之内症。
很明显，痘料透出后过盛的毒滞并没完全随之表发出来，最后用药无效，以致于身亡。
根据这些记载，有人便认为穆宗是死于天花，但这些记载只是宫廷里的片面记载，而民间的大多传闻却说穆宗是死于梅毒。
在一些正规学术著作里都记载着穆宗微服出宫，嬉戏游乐，甚至出入烟馆妓院的故事，如萧一山所著《清代通史》中就有穆宗因出游而患梅毒终致死亡的记载。
据记载，穆宗与皇后阿鲁特氏相亲相爱，但慈禧太后不喜欢阿鲁特氏。
慈禧开始常命皇后等人陪她看戏。
但皇后文静、不爱热闹，每次看到男女私情，则面壁而 坐。
慈禧本来对皇后就不满意，这样就更加不喜欢她了。
皇后多次受责怪，依旧我行我素，慈禧便觉皇后故意不给她面子。
而皇后对穆宗则是笑脸相迎，慈禧更认为 她狐媚惑主，于是限制穆宗宠爱皇后，强令其移爱慧妃。
而穆宗偏偏讨厌慈禧所喜欢的慧妃。
于是，穆宗与太监佞臣常常微服外出寻花问柳。
但穆宗怕臣下看见，不 敢去京中较大的妓院名楼，专门找隐蔽的小妓院、暗娼等处。
起初，人们对他的身份毫无所知，后来知道了也佯装不知。
一些王公大臣注意到穆宗微行纷传于内外，屡次劝谏穆宗而毫无成效。
一次，穆宗对醇亲王当面劝谏一再抵赖，醇亲王只好把时间、地点一一指明，穆宗却一再追问他消息的来源。
虽然这些传闻的真实性还有待考证，但这些传闻传扬甚广，而穆宗又死得可疑，因此许多人怀疑他死于梅毒也就不奇怪了。
据说，穆宗从烟花巷院染上梅毒，开始时毫无察觉，后来脸面、背部显出斑点，才召太医诊治。
御医一见大惊，不知如何是好，因此请命于慈禧。
慈禧传旨，向外 界宣布说皇上只是染上天花。
于是，御医们按照出痘的医法开药，没有效果。
皇帝大怒，责问: 为何不按我的病医治我？ 太医回奏: 太后命之。
而且《翁同 龢日记》中记载说: 风声过大，且非两宫圣意。
穆宗愤恨不已。
梅毒在当时是绝症，以天花治之，显然是为了掩盖丑闻，以免丢皇家脸面。
所以穆宗后来就日益 病重，下部溃烂而死。
穆宗究竟是死于天花还是死于梅毒，这两种说法各有各的来源，而且都能找出各自的证据，让人难以辨明，遂成清宫又一疑案。
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